Перед израильским нападением у Египта имелся 91 боевой истребитель МиГ-21, включая 76 боеготовых. На МиГ-21 у Египта имелось 97 лётчиков. Сирия имела 32 МиГ-21, Ирак 75 МиГ-21 и ещё 12 самолётов отправил на помощь Египту Алжир.
Утром 5-го июня израильская авиация атаковала египетские аэродромы и уничтожила на земле большую часть египетских МиГ-21. Против МиГ-21, которым удалось взлететь израильтянам пришлось труднее. Во время первого налёта на авиабазу Абу-Сувейр совершила взлёт пара МиГ-21ФЛ, которая атаковала четвёрку израильских истребителей SMB.2 и сбила одного из них, победу одержал А.Хамди, израильский пилот Д. Манор катапультировался и взят в плен. Ещё один SMB.2 был сбит другой парой египетских МиГ-21ФЛ. Позже с Абу-Сувейра совершил взлёт МиГ-21Ф-13, пилотируемый А.Мусри. Ему удалось перехватить два израильских «Миража» и поразить оба ракетами (по египетским данным оба самолёта были сбиты, по израильским оба самолёта были повреждены и вернулись на аэродром), при посадке египетский «миг» влетел в воронку от бомб и разбился, пилот погиб. Во время налётов на авиабазу Инчас египтяне спрятали один МиГ-21ФЛ в фруктовом саду. После окончания налётов на нём совершил взлёт египетский пилот Н.Шаокри и сбил израильский истребитель Mirage IIICJ, пилот Я.Нейман погиб. С Инчаса совершили взлёт ещё два МиГ-21Ф-13, один из них пилотировал Х.Кусри. Над Синаем египетский пилот перехватил группу израильских «Миражей» и сбил одного из них, пилотируемого Б.Ромачем, но при возвращении у египетского самолёта кончилось горючее и он разбился, пилот погиб. Второй «МиГ», пилотируемый М.Фуадом, смог в воздушном бою поразить ракетой израильский самолёт (тот смог вернуться на аэродром), но сам по ошибке был сбит своим ЗРК С-75 и погиб. В этот день, влетев в воронки от бомб на аэродроме Хургада, разбились два египетских МиГ-21, пилоты спаслись. При налёте на Файид израильский «Мистэр» атаковал взлетающий египетский МиГ-21, египетский самолёт взорвался, но осколками был тяжело повреждён израильский самолёт, пилот катапультировался. 6 июня египтяне потеряли один МиГ-21. Самолёт, пилотируемый И.Тауфиком совершил взлёт с авиабазы Абу-Сувейр и не вернулся с боевого задания, лётчик числится пропавшим без вести. Позже в этот день египетский МиГ-21ФЛ (пилот А.Наср) огнём 57мм НУРС сбил израильский истребитель SMB.2.
В ходе войны египетские МиГ-21 совершили четыре разведывательных вылета над пустыней Негев, в том числе над Ядерным центром. К удивлению египтян, ПВО, защищающая Ядерный центр, даже не пыталась открыть огонь (причиной этому было то, что днём ранее ПВО сбила свой самолёт). | 
