Ну наверное тем, что это разные ракеты, а лучше или хуже - сравнивать надо по результатам стрельб. Противокорабельная ракета 3М54Э состоит из стартовой ступени, крылатой дозвуковой низколетящей маршевой ступени и низколетящей сверхзвуковой боевой ступени с РДТТ.
3М-54Э1 это другая ракета и не обладает сверхзвуковой ступенью
